Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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