Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c1Q8K193 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34c1Q8K193 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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