Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d23Q8K0F1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms