Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms