Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Znf628Q8CJ78 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Znf628Q8CJ78 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Znf628Q8CJ78 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Znf628Q8CJ78 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Znf628Q8CJ78 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Znf628Q8CJ78 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Znf628Q8CJ78 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf628Q8CJ78 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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