Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serpina11Q8CIE0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina11Q8CIE0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms