Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upp2Q8CGR7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms