Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx8Q8CFD4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx8Q8CFD4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms