Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph6aQ8CDR2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph6aQ8CDR2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph6aQ8CDR2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rsph6aQ8CDR2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rsph6aQ8CDR2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph6aQ8CDR2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph6aQ8CDR2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms