Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atg4aQ8C9S8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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