Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa5Q8C7G5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apoa5Q8C7G5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apoa5Q8C7G5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa5Q8C7G5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms