Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfrp1Q8C4U3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp1Q8C4U3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp1Q8C4U3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms