Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TiparpQ8C1B2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TiparpQ8C1B2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms