Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pm20d1Q8C165 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pm20d1Q8C165 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pm20d1Q8C165 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms