Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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Cldn17Q8BXA6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn17Q8BXA6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn17Q8BXA6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Cldn17Q8BXA6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Cldn17Q8BXA6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Cldn17Q8BXA6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn17Q8BXA6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Cldn17Q8BXA6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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