Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skor1Q8BX46 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor1Q8BX46 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms