Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms