Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Pggt1bQ8BUY9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Pggt1bQ8BUY9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Pggt1bQ8BUY9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pggt1bQ8BUY9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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