Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT42

Smim5, Small integral membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim5Q8BT42 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smim5Q8BT42 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim5Q8BT42 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim5Q8BT42 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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