Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep55Q8BT07 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep55Q8BT07 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms