Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130116L18RikQ8BMV6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms