Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hirip3Q8BLH7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms