Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc4Q8BKW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc4Q8BKW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms