Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d3Q8BJ83 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms