Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms