Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Timm29Q8BGX2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm29Q8BGX2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms