Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp4f39Q8BGU0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp4f39Q8BGU0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms