Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca2Q8BG22 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca2Q8BG22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms