Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo1Q8BFY9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo1Q8BFY9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo1Q8BFY9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms