Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc155Q80VJ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc155Q80VJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc155Q80VJ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms