Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actr5Q80US4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actr5Q80US4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms