Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cul9Q80TT8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms