Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

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Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
NischQ80TM9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NischQ80TM9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms