Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Clec18aQ7TSQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec18aQ7TSQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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