Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms