Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sys1Q78S06 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sys1Q78S06 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms