Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssh1Q76I79 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ssh1Q76I79 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms