Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1cQ76I25 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1cQ76I25 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms