Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rph3alQ768S4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3alQ768S4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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