Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SynmQ70IV5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms