Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms