Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nemp1Q6ZQE4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nemp1Q6ZQE4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms