Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms