Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV6

Cd200r1l, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r1lQ6XJV6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd200r1lQ6XJV6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd200r1lQ6XJV6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r1lQ6XJV6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r1lQ6XJV6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms