Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asic3Q6X1Y6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asic3Q6X1Y6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asic3Q6X1Y6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asic3Q6X1Y6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asic3Q6X1Y6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asic3Q6X1Y6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asic3Q6X1Y6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic3Q6X1Y6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic3Q6X1Y6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms