Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn5Q6VZZ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms