Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2eQ6VUP9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2eQ6VUP9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms