Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Rhox8Q6VSS7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rhox8Q6VSS7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms