Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd300lfQ6SJQ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd300lfQ6SJQ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms