Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300ld3Q6SJQ5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd300ld3Q6SJQ5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms